R.G. Oroian


RAPD TECHNIQUE USED IN ANALYZING THE GENETIC STRUCTURE OF CYPRINUS CARPIO SPECIES – GALITIAN AND LAUSITZ VARIETIES

R.G. Oroian, T.E. Oroian, Crina Teodora Carsai, Viorica Cosier, L. Sasca

Abstract
The purpose of this study is to analyze the genetic structure of Cyprinus carpio species, Galitian and Lausitz varieties, from Arinis fishery, Maramures county, using RAPD technique. This work perfomed to improve the artificial reproduction, by making the pairing management using DNA fingerprinting. This manual labor was applied for all the reproduction individuals from the enlarged selection nucleus (150 individuals, 60 from each variety), with the ages between three and six summers. We present in the paper the data from 6 reproduction individuals used for reproduction in 2008. We gathered the biological samples from fish fins and scales, extracted the DNA, using phenol-chloroform method, verified the DNA purity and applied RAPD technique. From a total number of 50 RAPD primers used, only 3 from Operon series (OPM-14, OPM-12 and OPQ-09) allowed the observation of electrophoretic profiles of the amplified samples. We also made the similarity matrix of the two varieties, considering the line number, calculated based on Nei Lee-Dice similarity coefficient. Based on the existent similarity, we performed the UPGMA type dendrogram, represented by two base clusters, where are included the two varieties’ genotypes.

Key words: Cyprinus carpio, RAPD, DNA, dendrogram

TEHNICA RAPD UTILIZATA ÎN EVIDENTIEREA STRUCTURII GENETICE LA SPECIA CYPRINUS CARPIO - VARIETATILE GALITIANA SI LAUSITZ

R.G. Oroian, T.E. Oroian, Crina Teodora Carsai, Viorica Cosier, L. Sasca

Rezumat
Scopul acestei lucrari a fost de a studia structura genetica la specia Cyprinus carpio, varietatile Galitiana si Lausitz, provenite din Complexul piscicol Arinis, judetul Maramures, prin utilizarea tehnicii RAPD. Aceasta lucrare s-a efectuat pentru ca în programul de reproductie artificiala, dirijarea împerecherilor sa se efectueze dupa amprenta ADN. Aceasta operatiune s-a aplicat pentru toti reproducatorii nominalizati în nucleul largit de selectie (150 indivizi, câte 60 pe varietate), cu vârste cuprinse între 3 si 6 veri. În aceasta lucrare prezentam datele de la 6 reproducatori utilizati la reproductie în 2008. S-a efectuat prelevarea de probe biologice din aripioare si solzi, din care s-a extras ADN-ul, prin metoda cu fenol-cloroform, s-a verificat puritatea ADN-ului si s-a trecut la aplicarea tehnicii RAPD. Din totalul de 50 primeri RAPD utilizati, doar 3 din seria Operon (OPM-14, OPM-12 si OPQ-09) permit evidentierea profilelor electroforetice ale probelor amplificate. S-a efectuat matricea de similaritate, în functie de numarul de benzi, calculata pe baza coeficientului de similaritate Nei Lee-Dice la cele doua varietati. Pe baza valorilor similaritatii existente a fost alcatuita dendrograma de tip UPGMA, reprezentata de doua clustere de baza, în care sunt incluse genotipurile caracteristice celor doua varietati.

Cuvinte cheie: Cyprinus carpio, RAPD, ADN, dendrograma